Все материалы, поступившие в редакцию журнала «Философия. Журнал Высшей школы экономики», проходят рецензирование. На основании рецензий редакционный совет решает, публиковать ли материал (с доработками или без) или есть основания отказать автору в публикации.

Рецензирование проходит в два этапа:

1. Поступившая статья рассматривается главным редактором, заместителем главного редактора и/или членами редакционной коллегии на предмет соответствия тематике журнала и формальным требованиям. В случае несоответствия редакция уведомляет автора об отказе в рассмотрении публикации. В отдельных случаях редакция может предложить автору значительным образом переработать статью, оговаривая отдельно, в каком именно направлении необходима дополнительная работа. В этих случаях статья подается как новый материал. Как правило, редакция рассматривает поступившие материалы в срок до 1 месяца. Если принято решение отказать автору на данном этапе, автор получает уведомление по электронной почте.
2. Статьи, принятые к рассмотрению, отправляются двум анонимным рецензентам, один из которых, как правило, член редколлегии журнала, второй — сторонний специалист в данной области знания. Процедура рецензирования анонимная, т.е. редакция не раскрывает имен авторов и рецензентов. Рецензент заполняет специальную форму, в которой оценивает статью по ряду параметров, уточняет замечания к статье. Дополнительно рецензенты в свободной письменной форме могут дать развернутые комментарии к статье, содержащие подробный критический анализ сильных и слабых сторон статьи и рекомендации по ее доработке (структура, форма изложения и пр.). Все рецензии содержат рекомендацию опубликовать статью (с доработками или без) или отказать в публикации. Рецензии поступают в редакцию, которая принимает решение о публикации или отклонении статьи. Рассмотрение статьи рецензентами занимает до 6 месяцев.

Решение о публикации принимается в течение полугода с момента подачи материала в редакцию. В случае если необходима дополнительная экспертиза, статья отправляется дополнительным рецензентам. Редакция уведомляет о принятом решении по адресу электронной почты. Принятая к публикации статья проходит литературную редактуру. Окончательная версия статьи утверждается совместно редакцией и автором.

Публикация осуществляется в порядке общей очереди по мере готовности материала. Редакция вправе формировать очередь в соответствии c темами готовящихся выпусков.

При поступлении запроса от издателя, учредителя или других третьих лиц (в том числе представителей Министерства образования и науки РФ) материалы подготовки статьи к публикации (рецензии, протоколы обсуждения и др.) могут быть отправлены авторам запроса. Решение об этом принимается редакционной коллегией в каждом отдельном случае. Редакция обязуется хранить рецензии не менее пяти лет с момента поступления рецензий в редакцию.